Termin łącze ma kilka zastosowań: w tym przypadku jesteśmy zainteresowani odniesieniem się do jego znaczenia jako związku lub połączenia między różnymi elementami. Z drugiej strony peptyd jest związany z peptydami : cząsteczkami utworzonymi przez kowalencyjne połączenie aminokwasów (substancje organiczne, których skład cząsteczkowy ma grupę karboksylową i grupę aminową).

Nazywa się wiązanie peptydowe z wiązaniem chemicznym, które powstaje między grupą karboksylową aminokwasu i grupą aminową innego aminokwasu . Ten rodzaj połączenia, w którym utracona jest cząsteczka wody, pozwala na tworzenie wyżej wymienionych peptydów i białek .

Po związaniu grupy aminowej ( -NH2 ) i grupy karboksylowej ( -COOH ) z utratą cząsteczki wody, powstaje wiązanie CO-NH . Rozwój tego połączenia zawsze wymaga wkładu energii ; Z kolei po zerwaniu wiązania peptydowego następuje uwolnienie energii.

Łamanie wiązania peptydowego może nastąpić w wyniku hydrolizy : to się nazywa rozszczepianie, które cząsteczka rejestruje w wodzie. Hydroliza w środowisku naturalnym zachodzi bardzo wolno, chociaż możliwe jest przyspieszenie procesu za pomocą różnych technik .

W obecności wody wiązanie peptydowe może zostać zerwane z ilością energii swobodnej, która wynosi około 8-16 kilodżuli / mol (co odpowiada 2-4 kcal / mol). Jednostka kilodżuli na mol, która może być symbolizowana jako kJ / mol, jest rozpoznawana przez Międzynarodowy System Jednostek ( SI ) i odpowiada zależności między energią a ilością materii : energia jest wyrażana w kilodżulach, a materia jest mierzona w moli

Kojki to nie więcej niż tysiące dżuli, kolejna jednostka miary rozpoznawana przez system międzynarodowy, której pierwotna nazwa to dżul i jest używana do pomiaru ciepła, pracy i energii. Pod względem technicznym jego definicja to "ilość pracy wykonywanej przez newton o stałej sile wzdłuż metra w kierunku wspomnianej siły". Z drugiej strony jednostka miary służy do pomiaru ilości danej substancji i jest częścią siedmiu podstawowych wielkości fizycznych SI.

Aby przyspieszyć hydrolizę wiązania peptydowego, które w naturze może zająć więcej niż tysiąc lat, naukowcy mogą wybrać jedną z następujących metod :

* hydroliza kwasowa : osiąga się to pozostawiając białko we wrzącej wodzie przez długi czas roztworami o silnym kwasie (H2SO4 i HCl). Ta ścieżka osiąga całkowite zniszczenie tryptofanu i części treoniny i seryny;

* hydroliza zasadowa : zwykle prowadzi się ją za pomocą BaOH lub NaOH i nie niszczy aminokwasów wymienionych w poprzedniej metodzie;

* hydroliza enzymatyczna : u żywych istot ten sposób degradacji wiązań peptydowych jest najbardziej normalny. W tym przypadku, enzymy proteolityczne , które działają wolno i często nie kończą swojej pracy, ale nie następuje niszczenie aminokwasów ani racemizacja (gdy optycznie czynny związek staje się racemiczny) występuje. Ten typ hydrolizy jest bardzo specyficzny;

* hydroliza według temperatury : jeśli warunki są normalne, wiązania peptydowe nie są niszczone, ale białko można denaturować (to znaczy, jego struktury drugorzędowe, trzeciorzędowe i czwartorzędowe są zepsute). Z drugiej strony, jeśli temperatura wyższa niż 110 ° jest stosowana przez 48 godzin, można zniszczyć ogniwa.

Należy zauważyć, że na ogół wiązanie peptydowe jest reprezentowane jako pojedyncze wiązanie . W każdym razie ma kilka funkcji, które sprawiają, że jest blisko podwójnego łącza. Dlatego specjaliści zwykle wspominają, że wiązanie peptydowe ma właściwości, które umieszczają go w połowie drogi między pojedynczym łącznikiem a podwójnym łączem.