Aby poznać znaczenie terminu "protokół badawczy", konieczne jest przede wszystkim ustalenie pochodzenia etymologicznego dwóch słów, które je kształtują:
-Protocol pochodzi od greckiego "protokollon", utworzonego przez przedrostek "protos" (pierwszy) i "kollea" (ogon).
Z drugiej strony, dochodzenie pochodzi z łacińskiego "investigatio". To słowo, które oznacza "działanie i efekt znalezienia się", składa się z trzech różnych części: przedrostka "in" (do wewnątrz), rzeczownika "vestigium" (trace) i sufiksu "-cion" (action i efekt).

Protokół koncepcji z kilkoma zastosowaniami. Zwykle używa się go w odniesieniu do zestawu instrukcji lub zasad, które zgodnie z umową lub tradycją pozwalają kierować zachowaniem.

Z drugiej strony badania są procesem i wynikiem badań (metodyczne działania, które są przeprowadzane w celu zwiększenia wiedzy o czymś lub w celu dokonania odkrycia).

Protokoły badawcze są zatem przewodnikami opisującymi różne problemy, które są brane pod uwagę przy opracowywaniu prac badawczych. Jego celem jest uzgodnienie procedur wspólnych dla wszystkich naukowców, tak aby analiza wyników była ułatwiona, a wnioski z pracy można łatwo udostępnić.

Z drugiej strony, protokół badawczy zawiera odniesienia do pracy, która ma zostać opracowana i ustala, pod jakimi parametrami będą interpretowane wyniki projektu .

Po zakończeniu badań inny naukowiec może wziąć dany protokół i przestudiować zastosowaną dokumentację i podjęte kroki. W ten sposób społeczność naukowa jest w stanie rozważyć słuszność i jakość przeprowadzonych badań. Dzięki protokołowi badawczemu praca badawcza może być weryfikowana i powtarzana krok po kroku.

W szczególności, struktura, która jest niezbędna, aby protokół badań musiał mieć, jest następujący:
Tytuł dochodzenia i jego streszczenie.
- Unieważnienie.
- Końcowe cele i sposób zastosowania uzyskanych wyników.
- Podstawa teoretyczna.
-Ogólne i szczegółowe cele tej pracy badawczej.
- Metodologia
- Metody analizy wyników.
-Bibliografia

Można powiedzieć, że jest to podstawowa struktura wszelkich prowadzonych prac badawczych. Nie możemy jednak zignorować faktu, że konieczne jest również włączenie innych sekcji lub elementów, takich jak załączniki, harmonogram działań, które zostały zastosowane, wykorzystane źródła, a nawet finansowanie i narzędzia, które były używane do to.

W ten sam sposób nie wolno nam zapominać, że bardzo ważne jest, aby protokół badań charakteryzował się całkowitym, poważnym, odpowiedzialnym, elastycznym a nawet nadającym się do recyklingu. I w ten sposób osiągnie proponowane cele.

Oznacza to, że protokół badania powinien zawierać między innymi podsumowanie prac badawczych, opis problemu, szczegóły celów, zastosowane ramy teoretyczne, zastosowane techniki i metodologię zastosowaną do analizy wyników, a także inne dane.