Taksonomia pochodzi od greckiego słowa oznaczającego "święcenia" . Jest to nauka o klasyfikacji, która jest stosowana w biologii do systematycznej i hierarchicznej organizacji grup zwierzęcych i roślinnych .

W szczególności możemy ustalić, że taksonomia jest podzielona na dwie: mikrotaksonomię, która jest odpowiedzialna za wytyczanie i opisywanie pewnych gatunków; oraz makrotaksonomię, która jest klasyfikowana na podstawie kryteriów przyznawanych przez poprzednią gałąź.

Ważne jest również ustalenie, że taksonomia jest bardzo związana z tak zwaną systematyką. Można to zdefiniować jako naukę, która jest odpowiedzialna za prowadzenie badań relacji pokrewieństwa, zwanych także powinowactwami, które występują między różnymi gatunkami.

Wszystko to bez pomijania bliskiego powiązania istniejącego między taksonomią a innymi naukami lub zagadnieniami, takimi jak ewolucja, paleontologia, genetyka, biologia molekularna, filogeneza lub embriologia.

Taksonomia biologiczna jest częścią systematycznej biologii, poświęconej analizie relacji pokrewieństwa między organizmami. Kiedy drzewo filogenetyczne danego organizmu zostanie rozwiązane, a jego gałęzie ewolucyjne są znane, taksonomia jest odpowiedzialna za badanie relacji pokrewieństwa.

Oprócz tego należy podkreślić, że przy pracy z taksonomią, jej opracowywaniu i wprowadzaniu w życie ważne jest, aby wyjaśnić różne koncepcje, które są w niej fundamentalne. Tak będzie w przypadku:

Znak, który odnosi się na przykład do charakterystyki rośliny.

Stan postaci, czyli wartości, które może uzyskać postać.

Znaki diagnostyczne to te, które są wyraźnie używane do rozróżniania taksonów.

Pochodne postacie. Są one identyfikowane jako dynamiczne i dlatego, że mogą dostarczać informacji o pojawieniu się nowych linii. Wszystko to mogą zrobić ci, którzy są stanami, które mogą mieć postać w inny sposób niż ich przodek, ponieważ są modyfikowane.

Istnieją różne pozycje dotyczące taksonomii, chociaż ogólnie uważa się, że jego funkcja rozpoczyna się, gdy filogeneza taksonów jest już zdefiniowana. Dlatego taksonomia organizuje drzewo filogenetyczne w systemie klasyfikacji.

Najbardziej rozpowszechniony pogląd uznaje taksony jako klady (gałęzie drzewa filogenetycznego, z gatunkami spokrewnionymi przez wspólnego przodka), które zostały już przypisane do kategorii taksonomicznej.

Proces taksonomii kontynuowany jest poprzez przypisanie nazw (zgodnie z zasadami nomenklatury), opracowanie dychotomicznych kluczy identyfikacyjnych i stworzenie systemów klasyfikacji.

Taksony pozwalają na klasyfikację żywych istot z hierarchii włączenia (każda grupa obejmuje innych nieletnich, podporządkowanych temu większemu). Podstawowe kategorie, od najbardziej kompleksowej do najmniejszej, to domena, królestwo, krawędź lub podział, klasa, kolejność, rodzina, rodzaj i gatunek .

Należy zauważyć, że postępy w zakresie wiedzy o DNA i problemach różnorodności biologicznej stanowią wielkie wyzwanie dla taksonomii.